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mentaire du cours de médecine interne professé à la Charité par Corvisart, avait pour objet principal l'étude des maladies rares ou inconnues, les essais thérapeutiques et, généralement, l'exposition des parties les plus difficiles et les plus compliquées du diagnostic et du traitement des maladies internes ; objet assez vague ; Cabanis se proposa d’en faire une sorte de cours philosophique de méthodologie médicale et choisit pour thème de ses leçons l'exposition de la doctrine d’Hippocrate. On a retrouvé dans ses papiers deux discours qui étaient probablement destinés à être prononcés, l’un pour l'ouverture, l’autre pour la clôture de ce cours. La première expose le plan général du cours et les traits principaux de la médecine hippocratique, le second rappelle les devoirs du médecin, d'après Hippocrate, et traite, entre autres choses, de l’observation sans hypothèse, des erreurs involontaires, de la nécessité pour le médecin d'étudier le moral, de ses devoirs envers les malades, la société et la science, des conditions de réussite ou d’insuccès, etc... Ce cours ne fut jamais professé.

Le 25 Floréal, an IV (14 mai 1796), Cabanis épousait Charlotte Félicité de Grouchy, chanoinesse du chapitre noble de Neuvilleen-Bresse, de vieille noblesse normande, belle-sœur de Condorcet, et sœur du marquis de Grouchy, le futur maréchal. Il connaissait Charlotte de Grouchy depuis 1791, date à laquelle son amitié avec Condorcet avait pris un caractère plus intime, et il est permis de penser que la présence de cette jeune femme au foyer de l’encyclopédiste était pour quelque part dans l’assiduité de Cabanis à fréquenter chez lui. Moins belle que sa sœur Sophie, femme de Condorcet, Charlotte, était paraît-il, plus gracieuse ; son charme, la tournure de son esprit, modelé par un long commerce avec les philosophes et Condorcet, n’avaient point laissé Cabanis insensible; et ses sentiments, bientôt partagés, avaient créé la liaison tendre dont, dès le 7 octobre 1793, naïssait une fille: Aminte Geneviève. Mais sous la Terreur on ne se mariait guère officiellement, et Cabanis, suspect lui-même, avait préféré tenir secrète, même pour sa famille, son union effective avec la belle-sœur d’un proscrit. Et c’est encore avec circonspection que, le 7 Prairial an IV, il s’en ouvrait dans une lettre à sa sœur Françoise, ancienne ursuline à Brive : « Ce sentiment m'impose le devoir de t'apprendre, aussitôt que je le puis, une chose dont les circonstances m'ont forcé de faire un profond

secret et qui doit même encore rester quelque temps entre amis. Je suis marié avec la belle-sœur d’un ami que j’ai eu le malheur de perdre dans le cours de la tyrannie démagogique, de Condorcet. C’est une personne que j'avais connue longtemps avant de l'épouser, et dans qui, depuis cinq ans que je la vois chaque jour, je n'ai jamais aperçu que des choses propres à la faire estimer et chérir. C’est encore moins une femme d’esprit et une femme aimable, quoi qu'elle passe beaucoup pour être l’une et l’autre, qu'une excellente compagne et une bonne mère. Elle a une petite fille qu'on trouve intéressante et à qui nous apprendrons à t'aimer, quand elle commencera à pouvoir entendre le sens de ce mot. » La cérémonie du 25 Floréal, an IV, ne fut donc, en somme, que la régularisation de leur union. Les deux époux s'installèrent à Auteuil, chez Mme Helvétius qui eut autant de joie à les recevoir qu'elle en avait eu à accueillir le jeune Cabanis.

Cette même année, Cabanis entra à l’Institut, qui venait d’être fondé par la Convention, dans la classe des Sciences Morales et Politiques, section de l’analyse des sensations et des idées. Il publia dans le Magasin Encyclopédique une Note sur le supplice de la guillotine, en réponse à MM. Œlsner, Sœmmering et au citoyen Suë qui avaient prétendu que les condamnés éprouvaient encore des souffrances après la décapitation. Cette affirmation avait bouleversé les personnes dont quelque parent très cher était mort à l’échafaud. Cabanis la conteste, tout en protestant contre ce genre de supplice. Les mouvements que l’on observe après la décapitation ne prouvent, dit-il, ni la persistance de la sensibilité, ni la douleur ; l'intérêt de cet ouvrage est qu’on y trouve une première esquisse du système de psycho-physiologie qu’il devait bientôt développer longuement.

A la fin de l’an IV et au commencement de l’An V (1797) il lut à l'Institut les six premiers Mémoires de son travail sur les Rapports du Physique et du Moral de l'homme. Le succès de ces communications successives fut énorme et leur ensemble fut salué « comme le plus beau monument de la renaissance des études scientifiques ». Il se décide en 1797 à publier son Essai sur le Degré de certitude en médecine, qui était écrit depuis 1788.

En l’an VIII (1799) il fut transféré de la chaire de Clinique interne à celle de Médecine légale et d'Histoire de la médecine. Ses connaissances historiques, sa tournure d'esprit philosophique,