Les Lacs du Jura:
Recherches géologiques, botaniques et statistiques sur l’impaludisme dans la Dombes et le miasme paludien; 1 vol. in-8, 120 p., 8 tabl., 1 pl., Paris, 1876.
Etude sur les Lichens des vallées de l’Ubaye; broch. in-8, 1877.
Les Bactéries, monographie; 1 vol. in-8, 179p., Paris, Savy, 1878.
Recherches sur la Géographie botanique du Lyonnais; gr. in-8, 150 p., 2 pl. color., Paris, J-B. Baillière, 1879.
Bacteria, translated by G. M. Sternberg : Boston, in-8, 1880.
Origines de la végétation du Lyonnais; broch. in-8, 28 p., Lyon, Pitrat,
Fragments lichénologiques, fasc. I-III, 68 p., Lyon, 1881-1884.
Statistique botanique du département de l’Ain ; in-12,, 68 p., Bourg, 1883.
Bacteria by Dr A. Magnin and G. M. Sternberg; in-12, 494 p., 12 pl., 30 fig., New-York, 1884.
Claret de la Tourrette, ses travaux sur les Lichens du Lyonnais ; 1 vol. gr. in-8, 236 p., 2 pl.; Lyon, Georg et J.-B. Baillière, 1885.
La végétation de la région lyonnaise et de la partie moyenne du bassin du Rhône; 1 vol. gr. in-8, 513 p., 7 cartes color.; Lyon, Georg, 1886.
Note sur la présence des plantes calcifuges dans les chaînes calcaires du Jura. ( Académie des sciences, 20 décembre 1886.)
Enumération des plantes qui croissent dans le Beaujolais, précédée d’une notice sur Vaivolet ; 1 vol. in-8, 124 p., Lyon, Georg, 1887.
Sur l’hermaphrodisme parasitaire et le polymorphisme floral du Lychnis dioica. ( Académie des sciences, 22 octobre et 26 novembre 1888.)
Recherches sur le polymorphisme floral, la sexualité et l’hermaphrodisme parasitaire du Lychnis vespertina ; br. in-8, 30 p., 2 pl., 8 fig., Lyon, 1889.
Sur la castration parasitaire de YAnemone ranunculoides. ( Académie
des sciences, 28 avril 1890.)
Sur la castration androgène du Muscari comosum. ( Académie des sciences, 2 juin 1890; 31 octobre 1892.)
Observations sur le parasitisme et la castration chez les Anémones et les Euphorbes. ( Bulletin scientifique de M. Giard, t. XXIII, p. 412-436, 1 pl., août 1891.)
Nouvelles observations sur la sexualité, notamment du Lychnis diurna ; in-*8, 29 p., 1 pl., 1891.
Conditions biologiques de la végétation lacustre. ( Académie des sciences, 10 octobre 1892 ; 24 avril 1893.)
Végétation des Alpes françaises; in-12, 72 p., 1893.
Végétation des Monts- Jura ; in-8, 59 p., 1 carte, Besançon, 1893.
Recherches sur la végétation des lacs du Jura; in-8, 30 p.. 1893.