Lis sont orgueilleux, dit le conseil de Montbéliard
Ce nouveau Magistrat' résolut d'agir. Deux bourgeois de la ville, Guillaume Thourelotet GirardJean Sire, furent chargés de porter au duc Ulric qui était à Stuttgard, les doléances de leur cité? Ulric leur fit savoir, le 27 septembre, qu'ils pouvaient s'en retourner chez eux et qu'il leur ferait connaître sa réponse par l'intermédiaire du conseil de Montbéliard. Celui-ci, consulté par le duc, répondit que devant l'irritation du peuple, il valait mieux ne pas exécuter à la lettre: ni cette ordonnance, ni celles qui avaient précédé, aïnsi fut fait. « Ulric et son frère, dit le Précis de la Réformation, n’employèrent désormais que les voies de la persuasion, bien plus efficaces que n'auraient été la contrainte et la violence. »
Toussain qui n'avait point d'intérêt politique à sauvegarder et qui se plaçait au point de vue de l'idéal, était profondément affligé des obstacles que rencontrait la réforme de l'Eglise etdes mœurs. M. l'abbé Tournier, pour faire entendre que la Réforme à Montbéliard a été l'œuvre de la violence, fait du duc Ulric et de son frère les simples exécuteurs des volontés réformatrices de Toussain. Ecoutons Toussain luimême, Le 98 juin 1539, il écrit à Calvin : « Nos princes ont oublié le Seigneur. Il n’y a chez eux aucun vrai souci de la gloire de Dieu, des pauvres et de la justice. Chacun fait ce qu'il veut impunément. On laisse les campagnards sans pasteurs au milieu des loups. »
La protestation des bourgeois au nom de leurs franchises, contre la défense de fréquenter la messe au dehors vintencore augmenter sa tristesse. Mais il n’abandonna point la lutte.
C'est au contraire à cette époque, vers la fin de 1539 ou au commencement de 1540, qu'il remit au prince un mémoire qui nous a été conservé et qui renferme, énergiquement précisé, tout le programme de la Réforme.