DESCRIPTION DES PRINCIPALES ESPÈCES BACTÉRIENNES
L’analyse qualitative des bactéries contenues dans l’eau se trouve actuellement aux prises avec des difficultés que nous n’avions pas encore signalées et qui tiennent à l’insuffisance des classifications des espèces bactériennes.
Les différents projets de classification qui ont été proposés par d’éminents bactériologistes ne répondent qu’imparfaitement au but poursuivi. De même, la plupart des essais de Bore tentés avec l’intention de fournir une clef qui permette de délimiter assez étroitement u,n certain nombre de micro-organismes, ne sont pas à l’abri des critiques.
Dans la pratique, on a bien essayé de différencier les bactéries en les divisant soit en bactéries pathogènes et non pathogènes, soit d’après quelques caractères physiques tirés de la coloration des cultures, soit en se basant sur des propriétés particulières, telles que la liquéfaction ou la non-liquéfaction de la gélatine. Malheureusement, ces caractères sont éminemment variables, souvent chez la même espèce, et telle bactérie qui, par exemple, fournit une culture blanche, ne tarde pas, au bout de quelques jours, à se foncer en couleur et à prendre un aspect plus ou moins jaunâtre; d’autres, qui ne liquéfiaient pas la gélatine au début, se mettent à fluidifier peu à peu le substratum.
Malgré les critiques que nous venons de formuler, il faut bien, faute de mieux
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conserver la division basée sur le caractère de la liquéfaction de la gélatine par les bactéries, sur leur pouvoir chromogène et, enfin, surtout sur la propriété qu elles ont d’être ou non pathogènes. Ces divisions ne devront pas être considérées comme absolues pour les raisons que nous avons indiquées plus haul, et ne serviront qu’à faciliter les recherches bactériologiques qui nous occupent.
Les microbes peuvent être classés en trois grandes familles distinctes :
-1° La famille des Coccacées;
2° — des Bactériacées ;
3° — des Beggiatoacées.
La famille des Coccacées comprend quatre genres :
Le genre Micrococcus ;
— Sarcina;
— Ascococcus;
— Leuconostoc.
La famille des Bactériacées est divisée en plusieurs genres :
Le genre Bacillus;
— Spirillum ;
Cladothrix;
— Streptothrix ;
— Actinomyces.
Enfin, la troisième famille, celle des Beggiatoacées, comprend deux genres :
Le genre Beggiatoa;
— Crenothrix.
Nous ne parlerons que des micro-organismes qui se rencontrent le plus fréquemment dans les eaux; nous décrirons quelques. uns de leurs caractères les plus nets qui peuvent permettre de les différencier, et nous renverrons, pour plus de détails sur chaque espèce, aux traités de bactériologie.
FAMILLE DES COCCACÉES
Genre micrococcus ( espèces chromogènes).
Micrococcus prodigiosus (Ehrenberg).
Description. — Cellules ovales ou elliptiques de 0,3 p. à i p de diamètre; prend quelquefois des formes un peu plus allongées.
Sur plaques. — Colonies arrondies, couleur rosée; liquéfie la gélatine et la teinte en rose.
Produit sur pomme de terre ou sur noix de coco une culture rouge vif avéc reflets métalliques.
Se développe très bien sur le pain. — Matière colorante soluble dans l’alcool.
Micrococcus cinnabareus (Flügge).
Description. — Coccus ovoïdes assez gros mesurant 0,9 p de largeur. Réunis quelquefois en diplocoques ou en petits amas.
Sur plaques. — Colonies rondes en forme de boulon rouge brique ou jaune orangé. Liquéfie la gélatine à la longue.
Cultivé dans du bouillon, trouble celui-ci, qui devient visqueux et laisse un dépôt rouge brique.
Micrococcus aurantiacus (Schroeter).
Description. — Coccus elliptiques de 1 p à 1,5 g, réunis par 2, 4, ou en amas immobiles.
Sur plaques. — Colonies rondes ou elliptiques, à surface lisse brillante, jaune et jaune orangé en vieillissant. Ne liquéfie pas la gélatine.
Matière colorante peu soluble dans l’eau, l’alcool, etc.
Micrococcus roseus (Flügge).
Description. — Gros coccus mesurant 1,4 p de diamètre, réunis en diplocoques ou en chaînes de quelques éléments.
Sur plaques. — Colonies en forme de boulon rose, .mamelonné au centre. Ne liquéfie pas la gélatine, mais se ramollit à la longue et prend alors une teinte rouge.
Culture développe odeur fécaloïde.
Micrococcus flavus liquefaciens (Flügge).
Description. — Coccus gros, immobiles, réunis en nombre variable.
Sur plaques. — Colonies jaunâtres liquéfiant rapidement la gélatine, laissant sédiment jaune épais.
Sur pomme de terre, développement jaune brillant.
Micrococcus versicolor (Flügge).
Description. — Cellules rondes de 1,3 p. à 1,5 p, associées souvent en diplocoques.
Sur plaques. — Colonies circulaires jaune verdâtre, à reflets nacrés à bords irréguliers. Ne liquéfie pas la gélatine.
Micrococcus luteus (Adametz).
Description. — Coccus longs de 1,2 g. à 1,3 p. très mobiles, souvent réunis en diplocoques ou en chaînettes d’une dizaine d’éléments.
Sur plaques. — Colonies arrondies, jaunes, liquéfiant lentement la gélatine.
Sur pomme de terre, culture jaune brun.
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Genre mierococeus ( espèces ne produisant pas de matière colorante).
Micrococcus candicans (Fliigge).
Description. — Gros coccus de 1 a 2 p. de diamètre, immobiles.
Sur plaques. — Colonies jaunâtres en forme de disque lorsqu’elles se développent dans la masse de la gélatine. Ne liquéfie pas la gélatine.
Micrococcus ureæ (Van Tieghem).
Description. — Cellules sphériques de d ja à 1,5 (a de diamètre, réunies souvent en longues chaînettes.
Sur plaques. — Colonies d’un blanc nacré, en forme de disque. Ne liquéfie pas la gélatine; se développe avec tous ses caractères dans l’urine et transforme l’urée en carbonate d’ammoniaque. Plusieurs micrococcus, d’après M. Miquel, possèdent la propriété de décomposer l’urée.
Micrococcus viticulosus.
Description. — Cellules ovales mesurant d jj. de large sur 1,5 ja de long, réunis souvent en amas.
Sur plaques. — Les colonies superficielles sont blanchâtres, opaques et s'étendent, à l’aide de fils fins, dans la masse de la gélatine.
Les colonies développées dans la niasse se résolvent en fines branches partant du centre de la colonie. Ces branches sont constituées par des zooglées. Ne liquéfie pas la gélatine.
Micrococcus aquatilis (Meade Bolton).
Description. — Coccus arrondis de 0,5 p de diamètre, souvent en diplocoques.
Sur plaques. — Colonies rondes qui s’étendent assez rapidement, d’un blanc mat. De la partie centrale, plus foncée, partent un certain nombre de sillons qui donnent à la colonie l’aspect d’un aeinus du foie.
Les colonies qui se trouvent dans la profondeur de la gélatine sont rondes, dentelées et d’un jaune brillant. Ne liquéfie pas la gélatine.
Micrococcus concentricus (Zimmermann).
Description. — Coccus de 0,9 p de diamètre, disposés en amas irréguliers immobiles.
Sur plaques. — Les colonies, au début, paraissent comme de petits points gris bleu ; en s’étalant, elles prennent des contours irréguliers et conservent à peu près la même teinte.
Les colonies incluses dans la gélatine sont d’un gris jaunâtre et montrent pim sieurs cercles réguliers et concentriques. Ne liquéfie pas la gélatine.
Micrococcus fervidosus (Adametz).
Description. — Cellules rondes, de 0,6 p de diamètre, immobiles et affectant fréquemment la disposition en diplocoques.
Sur plaques. — Colonies ovoïdes, à bords dentelés, sinueux, faiblement jaunâtres.
Se développe dans les solutions sucrées avec faible production d’alcool et des traces d’acide acétique et lactique.
Micrococcus cremoïdes (Zimmermann).
Description. — Coccus ronds de 0,8 p de diamètre, réunis souvent en amas.
Sur plaques. — Colonies liquéfiant la gélatine en forme de cupule, et laissant un dépôt blanc jaunâtre au fond de la cupule.
Sur pomme de terre, on obtient une culture couleur crème.
Genre sarcina.
Sarcina rosea (Schrotter).
Description. — Cellules sphériques de 2 p de diamètre, réunies en paquets ■cubiques de 8 p de long.
Sur plaques. — Colonies incolores au début, ou faiblement jaunes; deviennent roses en liquéfiant la gélatine.
Sur pomme de terre, les cultures sont d’un beau rouge.
Matière colorante insoluble dans éther ou alcool.
Sarcina alba (Adametz).
Description. — Éléments arrondis, de 0,88 p de diamètre, immobiles.
Sur plaques. — Colonies rondes d’un blanc grisâtre. Liquéfie la gelée très lentement. Les colonies se développant dans la masse ont l’aspect de petites sphères grisâtres.
Sarcina aurantiaca (Koch).
Description. — Coccus immobiles.
Sur plaques. — Colonies en forme de petits disques jaune orangé. Forme une espèce de pellicule à bord relevé pouvant s’enlever en bloc. Liquéfie très lentement la gélatine.
Sur pomme de terre, sillon d’ensemencement jaune d’or.
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FAMILLE DES BAGTÉRIACÉES
Genre Bacillus chromogène.
Bacillus chlorinus (Macé).
. Description. — Gros bâtonnets mesurant 2 u. de longueur sur 1 p. de largeur, mobiles, sensibles à l’action de la lumière.
Sur plaques. — Colonies rondes jaune verdâtre. Liquéfie la gélatine assez rapidement.
Le bouillon ensemencé finit par devenir vert pomme. Matière colorante soluble dans l’alcool absolu.
Bacillus fluorescens liquefaciens (Flugge).
Description. — Bâtonnets courts de 1,5 jj. de longueur sur 0,4 \j. de largeur, réunis souvent deux par deux, mobiles.
Sur plaques. — Colonies rondes gris verdâtre, liquéfiant la gélatine peu à peu et la teignant en vert clair.
En culture dans du bouillon, ce dernier ne tarde pas à devenir d’un beau vert.
Le liquide est dichroïque.
Matière colorante soluble dans le chloroforme et l’alcool amylique.
Bacillus fluorescens putridus (Flugge).
Description. — Bâtonnets de 2 à 2,2 p de longueur sur 0,45 p de largeur, mobiles.
Sur plaques. — Colonies transparentes jaunâtres; s’étalent à la surface de la gélatine en forme de brioche très aplatie à bords sinueux, offrant quelque ressemblance avec les colonies du bacille typhique.
La gélatine se teint profondément en vert.
La culture dans le bouillon est dichroïque.
Matière colorante insoluble dans l’alcool, l’éther, le chloroforme, mais soluble dans l’alcool amylique et dans l’eau alcalinisée.
Bacillus cærulus (Smith).
Description. — Bâtonnets réunis en longues chaînes et mesurant 2 p de longueur sur 0,5 pi de largeur.
Sur gélatine. — Colonies circulaires liquéfiant la gélatine autour d’elles. La portion superficielle en contact avec l’air se colore en bleu. Sur pomme de terre, il.se forme une couche d’un bleu qui, avec le temps, devient de plus en plus sombre.
Matière colorante insoluble.
Il semble exister plusieurs variétés décrites par Claessen, Schroeter, Bujwid, sous le nom de bacillus violaceus, micrococcus violaceus, et même par Zopf, sous la dénomination de bacillus janthinus.
Bacillus flavus (Macé).
Description. — Bâtonnets mesurant 1,8 à 2 p de longueur sur 0,5 p de largeur, immobiles.
Sur plaques. — Colonies en forme de disque jaune brun, avec des reflets verdâtres. En piqûre, la gélatine est liquéfiée, le liquide est clair, il est recouvert par une pellicule épaisse jaune d’or.
Se développe sur pomme de terre en une couche épaisse jaune d’or.
Bacille rouge de Kiel (Bréunig).
Description. — Bâtonnets mesurant 3 à 5p de longueur sur 0,7 à 0,8 p. de largeur, immobiles.
Sur plaques. — Colonies blanchâtres dans la profondeur de la gélatine. A la surface, il se forme une colonie ronde, rouge sang.
Liquéfie la gélatine.
Les cultures sur gélose prennent, à la longue, des reflets métalliques.
La matière colorante est soluble dans l’alcool et insoluble dans le Chloroforme et l’alcool amylique.
Il existe plusieurs bactéries produisant une matière colorante rouge qui ont été décrites par Lustig, Eiselberg, Dowdeswel, Zimmermann, etc.
Genre Bacillus ne produisant pas de matière colorante.
Bacillus coli communis (Escherich).
Description. — Courts bâtonnets mesurantde 2 à 3 p de long, selon les milieux de culture, et 0,4 à 0,6 p de largeur, mobiles, animés d’un mouvement lent.
Sur plaques. — Colonies s’étalant assez rapidement en forme de brioche à bords ondulés, et dont la partie centrale est plus foncée; les bords ont des reflets irisés et la gélatine n’est pas liquéfiée.
Se différencie difficilement du bacille typhique et même, d'après certains auteurs, le bacillus coli communis serait une forme dégénérée du bacille typhique.
Le nombre de flagella ne paraît pas avoir fourni non plus un signe bien net pour différencier ces deux bactéries entre elles.
Bacillus typhosus (Eberth Gaffky;.
Description. — Bâtonnets mesurant en moyenne de 2 à 3 p de longueur sur 0,7 à 0,6 p de largeur, très mobiles, surtout lorsque les bacilles sont courts. Munis de flagella nombreux. Enfin, le bacille typhique est franchement aérobie.
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Sur plaques. — Les colonies, en forme de brioche, à contours irréguliers, s’étalent en amas minces et transparents à reflets bleuâtres. La forme de la colonie, autrefois caractéristique (comme beaucoup d’autres caractères spécifiques), n’a rien de spécial et se rencontre dans nombre d’autres espèces.
La culture sur pomme de terre ne présente aucune particularité et varie d’aspect suivant la nature de la pomme de terre employée.
Par l’aspect de ses colonies sur plaques et par ses autres caractères, le bacillus typhosus offre de très grandes ressemblances avec le bacillus coli communis.
Bacillus subtilis (Ehrenberg).
Description. — Bâtonnets tantôt isolés, tantôt en chaînes plus ou moinslongues, mesurant 4 à 5,5 p de longueur, sur 0,7 à 0,8 p de largeur, mobiles et possédant de longs cils aux deux extrémités du bâtonnet. Bacille aérobie vrai.
Sur plaques. — Colonies rondes jaunes s’étalant en taches à bords sinueux transparents. Liquéfie la gélatine; commence au centre de la colonie pour gagner ensuite la périphérie. De nombreux prolongements fins terminent les bords de la colonie.
Sur pomme de terre, culture épaisse, crémeuse.
Offre certaines analogies avec le bacillus anthraceus, mais n’est pas pathogène, ce qui l'en différencie.
Bacillus mesentericus vulgatus (Flugge).
Description. — Bâtonnets épais, courts, de 1,2 p de longueur sur 0,9 p de largeur, très souvent réunis en chaînes plus ou moins longues.
Sur plaques. — Colonies jaunâtres dont la partie centrale, plus [sombre, est entourée d’une zone claire où commence la liquéfaction de la gélatine. De la phériphérie partent de nombreux et courts filaments qui donnent l’aspect cilié à la colonie.
Se développe abondamment sur pomme de terre. La couche est plissée, d’un blanc brunâtre en vieillissant.
Attaque les matières amylacées et les transforme en glucose.
Bacillus radicosus.
Description. — Courts bâtonnets mesurant 2 p de longueur sur 1 p de largeur, réunis fréquemment en chaînettes ; peu mobiles.
Sur plaques. — Colonies sous forme de petit nuage blanc, composé par l’enchevêtrement de filaments très fins, tordus.
Liquéfie rapidement la gélatine.
Culture abondante et grisâtre sur pomme de terre.
Bacillus termo (Dujardin).
Description. — Courts bâtonnets mobiles mesurant de 2 à 3 p de longueur, en moyenne, sur 0,6 à 1,8 p de largeur. Aérobie.
Sur plaques. — Colonies blanchâtres circulaires, envahissant les cultures sur plaques et liquéfiant promptement la gélatine.
Trouble rapidement le bouillon en produisant un mince voile. Odeur sui generis.
Bacillus vulgaris (Hauser).
Description. — Bâtonnets mesurant jusqu’à 4 p. de longueur sur 0,6 p de largeur, très mobiles.
Sur plaques. — Colonies caractéristiques jaunes, d’où partent, dans diverses directions, des prolongements en forme de chapelets de grosseur très variable. Ces chapelets peuvent se déplacer et quitter la colonie mère.
Liquéfie très rapidement la gélatine.
Se développe très abondamment dans le bouillon en dégageant une odeur putride.
Les caractères du bacillus vulgaris sont à peu près les mêmes que ceux appartenant au bacillus mirabilis (Hauser) ou proteus mirabilis.
Bacillus ureæ (Miquel).
Description. — Bâtonnets minces de moins de 1 p de largeur réunis en longs filaments. Aérobie facultatif.
Sur plaques. — Colonies en forme de disque opalescent, à bords sinueux. Ne liquéfie pas la gélatine.
Se développe dans du bouillon auquel on ajoute de l’urée, qu’il transforme énergiquement en carbonate d’ammoniaque.
Il existe, d’après M. Miquel, un certain nombre de bacilles qui jouissent de la propriété de faire fermenter l’urée.
Genre Spirilluni.
Spirillum choleræ (Koch).
Description. — Courts bâtonnets de 1,5 à 3(*de longueur, sur 0,4 à 0,6 p de largeur. La courbure est très variable, la mobilité est très grande vers 30 à 35°. Munis de flagella. Aérobie vrai.
Sur plaques. Colonies rondes en forme de disque granuleux, liquéfiant la gélatine assez lentement.
Sur glucose, on obtient sur des cultures de plusieurs jours la production d’une matière colorante rouge (Choléra Roth).
La réaction rouge de Budjwid, obtenue en additionnant de 5 à 10 p. 100 d’acide chlorhydrique une culture pure, est produite par des traces d’indol. Celte réaction est commune à d’autres espèces voisines.
La courte; monographie que nous venons de faire des principales espèces bactériennes qui se rencontrent le plus fréquemment dans les eaux sera souvent
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insuffisante pour distinguer une espèce d’une autre espèce voisine à peu près similaire. Elle fournira, cependant, quelques renseignements qui permettront de consulter plus facilement les ouvrages de bactériologie.
Nous ne saurions trop répéter ce que nous avons dit au cours de cette monographie, à savoir qu’aucun des caractères particuliers à certaines bactéries ne peut constituer un critérium absolu pour la distinction des espèces.
Nous avons signalé déjà le peu de valeur que présente la propriété inhérente à quelques bactéries de fabriquer des principes colorés, et l’indice assez vague que l’on peut tirer de la liquéfaction ou de la non-liquéfaction de la gélatine, attendu que ces deux particularités varient souvent chez la même espèce.
A l’égard des mensurations que nous donnons au début de la description de chaque espèce et qui, a priori, semblent devoir fournir des indications très nettes, les mêmes rectrictions s’imposent.
Il aurait fallu, pour que ces mensurations présentassent un caractère de quasicertitude, que l’on spécifiât dans quel milieu se développaient les bactéries au moment où on les mesurait. Malheureusement, ce renseignement n’est pas, en général, fourni par les auteurs qui décrivent les bactéries étudiées par eux.
Il en résulte que quand on a affaire à des bactéries non pathogènes ou, en d’autres termes, lorsque le réactif physiologique fait absolument défaut, on se trouve fort embarrassé, la plupart du temps, pour distinguer des espèces dont les caractères macroscopiques paraissent semblables.
La bactériologie, comme toute science à son début, est remplie de lacunes qu’il faudra combler. Avec le temps, les obstacles s’aplaniront, et l’on sortira des tâtonnements inévitables. Mais il importe au plus haut point, malgré les difficultés présentes, de pratiquer les analyses bactériologiques des eaux non pas seulement pour obtenir la numération des bactéries contenues par centimètre cube, mais en se plaçant aussi et surtout au point de vue qualitatif.
A cette seule condition, on obtiendra des résultats sérieux et l’on pourra marcher plus avant dans l’étude éminemment intéressante des espèces bactériennes.
